Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHLDB3Q6NSJ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHLDB3Q6NSJ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHLDB3Q6NSJ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHLDB3Q6NSJ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHLDB3Q6NSJ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHLDB3Q6NSJ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms