Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LCN12Q6JVE5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN12Q6JVE5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCN12Q6JVE5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN12Q6JVE5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms