Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CENPPQ6IPU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPPQ6IPU0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPPQ6IPU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPPQ6IPU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CENPPQ6IPU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPPQ6IPU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CENPPQ6IPU0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPPQ6IPU0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPPQ6IPU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPPQ6IPU0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CENPPQ6IPU0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPPQ6IPU0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPPQ6IPU0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPPQ6IPU0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPPQ6IPU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPPQ6IPU0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPPQ6IPU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPPQ6IPU0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPPQ6IPU0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPPQ6IPU0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CENPPQ6IPU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CENPPQ6IPU0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPPQ6IPU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms