Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO4Q6EEV6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUMO4Q6EEV6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUMO4Q6EEV6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO4Q6EEV6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms