Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf8Q6DID3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf8Q6DID3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf8Q6DID3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf8Q6DID3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf8Q6DID3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf8Q6DID3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf8Q6DID3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf8Q6DID3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf8Q6DID3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf8Q6DID3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf8Q6DID3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf8Q6DID3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scaf8Q6DID3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf8Q6DID3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf8Q6DID3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf8Q6DID3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scaf8Q6DID3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf8Q6DID3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scaf8Q6DID3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf8Q6DID3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scaf8Q6DID3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scaf8Q6DID3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scaf8Q6DID3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Scaf8Q6DID3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scaf8Q6DID3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms