Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmcc1Q69ZZ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmcc1Q69ZZ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmcc1Q69ZZ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmcc1Q69ZZ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmcc1Q69ZZ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmcc1Q69ZZ6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmcc1Q69ZZ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmcc1Q69ZZ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmcc1Q69ZZ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmcc1Q69ZZ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmcc1Q69ZZ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmcc1Q69ZZ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmcc1Q69ZZ6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmcc1Q69ZZ6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms