Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sptbn2Q68FG2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn2Q68FG2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sptbn2Q68FG2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sptbn2Q68FG2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn2Q68FG2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms