Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
INTS3Q68E01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
INTS3Q68E01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
INTS3Q68E01 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
INTS3Q68E01 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
INTS3Q68E01 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
INTS3Q68E01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
INTS3Q68E01 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
INTS3Q68E01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
INTS3Q68E01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
INTS3Q68E01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
INTS3Q68E01 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms