Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnna3Q65CL1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnna3Q65CL1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctnna3Q65CL1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctnna3Q65CL1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctnna3Q65CL1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnna3Q65CL1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ctnna3Q65CL1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnna3Q65CL1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ctnna3Q65CL1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ctnna3Q65CL1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnna3Q65CL1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnna3Q65CL1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna3Q65CL1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnna3Q65CL1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna3Q65CL1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna3Q65CL1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnna3Q65CL1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms