Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VclQ64727 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VclQ64727 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VclQ64727 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VclQ64727 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VclQ64727 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VclQ64727 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VclQ64727 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VclQ64727 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VclQ64727 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VclQ64727 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VclQ64727 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VclQ64727 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VclQ64727 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VclQ64727 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VclQ64727 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VclQ64727 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VclQ64727 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VclQ64727 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VclQ64727 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VclQ64727 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VclQ64727 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VclQ64727 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VclQ64727 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VclQ64727 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VclQ64727 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VclQ64727 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VclQ64727 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VclQ64727 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VclQ64727 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VclQ64727 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VclQ64727 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VclQ64727 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VclQ64727 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VclQ64727 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VclQ64727 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VclQ64727 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VclQ64727 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VclQ64727 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VclQ64727 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VclQ64727 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VclQ64727 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VclQ64727 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VclQ64727 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VclQ64727 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VclQ64727 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VclQ64727 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VclQ64727 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VclQ64727 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VclQ64727 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VclQ64727 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VclQ64727 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VclQ64727 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VclQ64727 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VclQ64727 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VclQ64727 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VclQ64727 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VclQ64727 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VclQ64727 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VclQ64727 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VclQ64727 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VclQ64727 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VclQ64727 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VclQ64727 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VclQ64727 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VclQ64727 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VclQ64727 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VclQ64727 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VclQ64727 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VclQ64727 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VclQ64727 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VclQ64727 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VclQ64727 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VclQ64727 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VclQ64727 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VclQ64727 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VclQ64727 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VclQ64727 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VclQ64727 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VclQ64727 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VclQ64727 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VclQ64727 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VclQ64727 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VclQ64727 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VclQ64727 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VclQ64727 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VclQ64727 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VclQ64727 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VclQ64727 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VclQ64727 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VclQ64727 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VclQ64727 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VclQ64727 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VclQ64727 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VclQ64727 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VclQ64727 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VclQ64727 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VclQ64727 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VclQ64727 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VclQ64727 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms