Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gja3Q64448 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gja3Q64448 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gja3Q64448 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gja3Q64448 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gja3Q64448 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gja3Q64448 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gja3Q64448 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gja3Q64448 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gja3Q64448 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gja3Q64448 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Gja3Q64448 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gja3Q64448 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gja3Q64448 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gja3Q64448 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gja3Q64448 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gja3Q64448 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gja3Q64448 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gja3Q64448 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gja3Q64448 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gja3Q64448 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gja3Q64448 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gja3Q64448 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gja3Q64448 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gja3Q64448 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gja3Q64448 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Gja3Q64448 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gja3Q64448 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gja3Q64448 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gja3Q64448 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gja3Q64448 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gja3Q64448 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms