Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim24Q64127 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim24Q64127 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim24Q64127 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim24Q64127 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim24Q64127 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim24Q64127 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim24Q64127 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim24Q64127 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim24Q64127 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim24Q64127 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim24Q64127 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim24Q64127 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim24Q64127 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim24Q64127 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim24Q64127 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim24Q64127 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim24Q64127 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim24Q64127 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim24Q64127 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim24Q64127 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim24Q64127 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms