Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Defa17Q64016 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Defa17Q64016 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Defa17Q64016 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Defa17Q64016 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Defa17Q64016 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Defa17Q64016 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms