Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zic2Q62520 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zic2Q62520 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zic2Q62520 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zic2Q62520 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zic2Q62520 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zic2Q62520 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zic2Q62520 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 658.1 ms