Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp1Q62442 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vamp1Q62442 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp1Q62442 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms