Protein–RNA interactions for Protein: Q62440

Tle1, Transducin-like enhancer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle1Q62440 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tle1Q62440 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tle1Q62440 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tle1Q62440 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tle1Q62440 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tle1Q62440 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tle1Q62440 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tle1Q62440 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tle1Q62440 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tle1Q62440 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tle1Q62440 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tle1Q62440 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tle1Q62440 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tle1Q62440 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tle1Q62440 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tle1Q62440 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tle1Q62440 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tle1Q62440 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tle1Q62440 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tle1Q62440 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tle1Q62440 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tle1Q62440 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tle1Q62440 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tle1Q62440 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tle1Q62440 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tle1Q62440 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tle1Q62440 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tle1Q62440 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tle1Q62440 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tle1Q62440 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tle1Q62440 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tle1Q62440 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tle1Q62440 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tle1Q62440 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tle1Q62440 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms