Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha6Q62413 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha6Q62413 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha6Q62413 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha6Q62413 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms