Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spa17Q62252 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spa17Q62252 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spa17Q62252 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spa17Q62252 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spa17Q62252 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spa17Q62252 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spa17Q62252 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spa17Q62252 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spa17Q62252 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spa17Q62252 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spa17Q62252 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spa17Q62252 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spa17Q62252 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spa17Q62252 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms