Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Npm1Q61937 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Npm1Q61937 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Npm1Q61937 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Npm1Q61937 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Npm1Q61937 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
Npm1Q61937 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Npm1Q61937 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Npm1Q61937 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Npm1Q61937 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Npm1Q61937 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Npm1Q61937 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Npm1Q61937 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
Npm1Q61937 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Npm1Q61937 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Npm1Q61937 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Npm1Q61937 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Npm1Q61937 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Npm1Q61937 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Npm1Q61937 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Npm1Q61937 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Npm1Q61937 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Npm1Q61937 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Npm1Q61937 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Npm1Q61937 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Npm1Q61937 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Npm1Q61937 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Npm1Q61937 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Npm1Q61937 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Npm1Q61937 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Npm1Q61937 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Npm1Q61937 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Npm1Q61937 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Npm1Q61937 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Npm1Q61937 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Npm1Q61937 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Npm1Q61937 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Npm1Q61937 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Npm1Q61937 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Npm1Q61937 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Npm1Q61937 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Npm1Q61937 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Npm1Q61937 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Npm1Q61937 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Npm1Q61937 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Npm1Q61937 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Npm1Q61937 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Npm1Q61937 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Npm1Q61937 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Npm1Q61937 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Npm1Q61937 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms