Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama3Q61789 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lama3Q61789 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lama3Q61789 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lama3Q61789 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lama3Q61789 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lama3Q61789 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lama3Q61789 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lama3Q61789 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lama3Q61789 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lama3Q61789 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Lama3Q61789 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lama3Q61789 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Lama3Q61789 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lama3Q61789 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lama3Q61789 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama3Q61789 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama3Q61789 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lama3Q61789 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lama3Q61789 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lama3Q61789 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lama3Q61789 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lama3Q61789 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lama3Q61789 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lama3Q61789 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms