Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Itga6Q61739 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Itga6Q61739 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Itga6Q61739 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Itga6Q61739 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Itga6Q61739 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Itga6Q61739 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Itga6Q61739 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Itga6Q61739 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Itga6Q61739 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Itga6Q61739 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Itga6Q61739 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Itga6Q61739 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Itga6Q61739 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Itga6Q61739 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Itga6Q61739 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Itga6Q61739 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Itga6Q61739 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Itga6Q61739 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Itga6Q61739 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Itga6Q61739 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Itga6Q61739 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Itga6Q61739 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Itga6Q61739 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms