Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms