Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim25Q61510 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim25Q61510 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim25Q61510 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim25Q61510 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim25Q61510 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms