Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd53Q61451 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd53Q61451 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd53Q61451 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd53Q61451 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd53Q61451 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd53Q61451 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms