Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cntn2Q61330 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntn2Q61330 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cntn2Q61330 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntn2Q61330 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntn2Q61330 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cntn2Q61330 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cntn2Q61330 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cntn2Q61330 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntn2Q61330 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntn2Q61330 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cntn2Q61330 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntn2Q61330 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cntn2Q61330 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cntn2Q61330 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntn2Q61330 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntn2Q61330 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntn2Q61330 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntn2Q61330 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntn2Q61330 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntn2Q61330 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntn2Q61330 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntn2Q61330 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms