Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mre11Q61216 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mre11Q61216 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mre11Q61216 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mre11Q61216 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Mre11Q61216 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mre11Q61216 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mre11Q61216 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mre11Q61216 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1110.7 ms