Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Laptm4aQ60961 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Laptm4aQ60961 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Laptm4aQ60961 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Laptm4aQ60961 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Laptm4aQ60961 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms