Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cep250Q60952 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep250Q60952 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cep250Q60952 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cep250Q60952 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms