Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Foxd4Q60688 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxd4Q60688 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd4Q60688 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Foxd4Q60688 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd4Q60688 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxd4Q60688 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms