Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJE5

Leo1, RNA polymerase-associated protein LEO1, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Leo1Q5XJE5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Leo1Q5XJE5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Leo1Q5XJE5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Leo1Q5XJE5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Leo1Q5XJE5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Leo1Q5XJE5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Leo1Q5XJE5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Leo1Q5XJE5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Leo1Q5XJE5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Leo1Q5XJE5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Leo1Q5XJE5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Leo1Q5XJE5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Leo1Q5XJE5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Leo1Q5XJE5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Leo1Q5XJE5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Leo1Q5XJE5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Leo1Q5XJE5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Leo1Q5XJE5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Leo1Q5XJE5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Leo1Q5XJE5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Leo1Q5XJE5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Leo1Q5XJE5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Leo1Q5XJE5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Leo1Q5XJE5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Leo1Q5XJE5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Leo1Q5XJE5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Leo1Q5XJE5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Leo1Q5XJE5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Leo1Q5XJE5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Leo1Q5XJE5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Leo1Q5XJE5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Leo1Q5XJE5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Leo1Q5XJE5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Leo1Q5XJE5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms