Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpn1lQ5XFR0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpn1lQ5XFR0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpn1lQ5XFR0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpn1lQ5XFR0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpn1lQ5XFR0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms