Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC23Q5W5X9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC23Q5W5X9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC23Q5W5X9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC23Q5W5X9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC23Q5W5X9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTC23Q5W5X9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC23Q5W5X9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms