Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MALRD1Q5VYJ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MALRD1Q5VYJ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MALRD1Q5VYJ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MALRD1Q5VYJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MALRD1Q5VYJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MALRD1Q5VYJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms