Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD13Q5VXD3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD13Q5VXD3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SAMD13Q5VXD3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD13Q5VXD3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8390.3 ms