Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM208BQ5VWN6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM208BQ5VWN6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM208BQ5VWN6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM208BQ5VWN6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM208BQ5VWN6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM208BQ5VWN6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM208BQ5VWN6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM208BQ5VWN6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM208BQ5VWN6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM208BQ5VWN6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM208BQ5VWN6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM208BQ5VWN6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM208BQ5VWN6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM208BQ5VWN6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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