Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF8Q5VWM4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF8Q5VWM4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF8Q5VWM4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRAMEF8Q5VWM4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF8Q5VWM4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF8Q5VWM4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms