Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWC8

HACD4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD4Q5VWC8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD4Q5VWC8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD4Q5VWC8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD4Q5VWC8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD4Q5VWC8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms