Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BROXQ5VW32 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BROXQ5VW32 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BROXQ5VW32 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BROXQ5VW32 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BROXQ5VW32 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BROXQ5VW32 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BROXQ5VW32 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BROXQ5VW32 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BROXQ5VW32 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BROXQ5VW32 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms