Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD1Q5VV17 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD1Q5VV17 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
OTUD1Q5VV17 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OTUD1Q5VV17 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTUD1Q5VV17 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms