Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC39BQ5VTQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39BQ5VTQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TTC39BQ5VTQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC39BQ5VTQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC39BQ5VTQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC39BQ5VTQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC39BQ5VTQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC39BQ5VTQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms