Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF38BQ5VTL8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF38BQ5VTL8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF38BQ5VTL8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF38BQ5VTL8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF38BQ5VTL8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms