Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT03

NUTM2D, NUT family member 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUTM2DQ5VT03 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NUTM2DQ5VT03 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NUTM2DQ5VT03 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NUTM2DQ5VT03 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NUTM2DQ5VT03 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NUTM2DQ5VT03 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NUTM2DQ5VT03 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NUTM2DQ5VT03 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NUTM2DQ5VT03 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NUTM2DQ5VT03 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NUTM2DQ5VT03 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NUTM2DQ5VT03 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
NUTM2DQ5VT03 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NUTM2DQ5VT03 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NUTM2DQ5VT03 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NUTM2DQ5VT03 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NUTM2DQ5VT03 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NUTM2DQ5VT03 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NUTM2DQ5VT03 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NUTM2DQ5VT03 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NUTM2DQ5VT03 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NUTM2DQ5VT03 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NUTM2DQ5VT03 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NUTM2DQ5VT03 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NUTM2DQ5VT03 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
NUTM2DQ5VT03 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NUTM2DQ5VT03 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NUTM2DQ5VT03 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NUTM2DQ5VT03 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NUTM2DQ5VT03 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUTM2DQ5VT03 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NUTM2DQ5VT03 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUTM2DQ5VT03 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms