Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd5Q5VCS6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tdrd5Q5VCS6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd5Q5VCS6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tdrd5Q5VCS6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd5Q5VCS6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd5Q5VCS6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd5Q5VCS6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd5Q5VCS6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd5Q5VCS6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd5Q5VCS6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd5Q5VCS6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd5Q5VCS6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd5Q5VCS6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd5Q5VCS6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd5Q5VCS6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms