Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF648Q5T619 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF648Q5T619 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF648Q5T619 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF648Q5T619 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms