Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Specc1Q5SXY1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Specc1Q5SXY1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Specc1Q5SXY1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Specc1Q5SXY1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Specc1Q5SXY1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms