Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med13Q5SWW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med13Q5SWW4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med13Q5SWW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med13Q5SWW4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med13Q5SWW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med13Q5SWW4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med13Q5SWW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med13Q5SWW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Med13Q5SWW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med13Q5SWW4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med13Q5SWW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med13Q5SWW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med13Q5SWW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med13Q5SWW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Med13Q5SWW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med13Q5SWW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med13Q5SWW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med13Q5SWW4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med13Q5SWW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med13Q5SWW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med13Q5SWW4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med13Q5SWW4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med13Q5SWW4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 373.1 ms