Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Psme4Q5SSW2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Psme4Q5SSW2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Psme4Q5SSW2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Psme4Q5SSW2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Psme4Q5SSW2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Psme4Q5SSW2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Psme4Q5SSW2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psme4Q5SSW2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme4Q5SSW2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme4Q5SSW2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme4Q5SSW2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psme4Q5SSW2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Psme4Q5SSW2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Psme4Q5SSW2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Psme4Q5SSW2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Psme4Q5SSW2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Psme4Q5SSW2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Psme4Q5SSW2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Psme4Q5SSW2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psme4Q5SSW2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psme4Q5SSW2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psme4Q5SSW2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psme4Q5SSW2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Psme4Q5SSW2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Psme4Q5SSW2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Psme4Q5SSW2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psme4Q5SSW2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psme4Q5SSW2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psme4Q5SSW2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psme4Q5SSW2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psme4Q5SSW2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psme4Q5SSW2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms