Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2D4BQ5SQS7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D4BQ5SQS7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH2D4BQ5SQS7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH2D4BQ5SQS7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH2D4BQ5SQS7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms