Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf12Q5SPL2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf12Q5SPL2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf12Q5SPL2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf12Q5SPL2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phf12Q5SPL2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf12Q5SPL2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms