Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trav3-1Q5R1I8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav3-1Q5R1I8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav3-1Q5R1I8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav3-1Q5R1I8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav3-1Q5R1I8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms